公元1990年, 随着地球人口不断膨胀，引发了资源短缺、环境污染等诸多问题，世界各地战乱不断。人类社会宣布统一，成立地球联邦政府，并发表“宇宙移民计划”。

　　随后，地球开始陆续建起殖民卫星，地球的周遭漂浮着数百座巨大的太空殖民地，宙域被划分为SIDE 1至SIDE 7七个区域。在第一个殖民星完成之时，宇宙世纪(Universal Century，简称U.C.)纪元开始使用。 联邦政府长期对宇宙住民采取不公正的歧视政策， 地球联邦政府的腐化和殖民政策的变质令宇宙住民不满联邦的统治，矛盾激化。 倡导SIDE国家主义和新人类学说的激进思想家吉恩·什姆·戴肯批评联邦政府的政策，领导独立运动。

　　U.C.0053年，前往离地球最远的SIDE 3的吉恩·戴肯当选SIDE 3首相，并于U.C.0058年发表独立宣言，吉恩共和国成立，戴肯被尊为国父。此举引发各殖民地独立运动的激化，联邦政府开始对SIDE 3实施经济制裁，并开始扩充军备。 “一年战争”拉开帷幕，这是整个宇宙世纪历史上规模最大、影响最深远的战争，战争范围遍布整个地球圈。这场战争的主角是一批拥有强大攻击力的机动战士高达。

　　早在“一年战争”的初期，吉恩军的机动战士配合米诺夫斯基粒子所发挥的强大战斗力令联邦军损失惨重。随后战争陷入胶着状态，持续了8个多月， 联邦军开始在边境的SIDE7秘密进行着称为V作战的新型MS开发计划。 然而就在“V计划”计划的似乎一切顺利时，吉恩军获悉了情报……