副本是游戏中获取装备、宝石碎片的主要途径，掌上飞仙的副本分为普通副本和精英副本两种。普通副本是根据玩家角色主线任务的进度逐步开放的，而精英副本妖魔道则要完成指定任务才可以挑战。

　　精英副本-妖魔道

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　　副本消耗：精英副本不消耗精力值，每个怪物只能挑战一次，重置后可以再次挑战。重置次数根据VIP等级的变化最高可达到3次，V0玩家可免费重置1次，V1玩家2次，V5以上玩家3次。除了第一次重置免费外，余下重置次数需要消耗一定元宝。

　　副本掉落：副本道具奖励随机掉落紫色装备、高级宝石碎片。

　　副本扫荡：副本通关后才是可以使用扫荡功能，达到V2可以瞬间完成。